Les académiciens ont diverses façons de classifier les maladies. D'une part, les spécialistes des laboratoires (bactériologistes, virologistes, etc.) vont privilégier les systèmes de classification basés sur les caractéristiques des pathogènes. D'autres parts, les spécialistes de la dispersion des maladies (épidémiologistes) vont plutôt privilégier les classification basés sur la dispersion et la transmission de la maladie entre les individus à la ferme et entre les fermes.

Cette page donne des information très générale sur les concepts de maladies endémiques et maladies émergentes.

Présence continue d'une maladie dans une population ou une région donnée Voir la référence.

Les maladies endémiques présentes au Canada varient selon les espèces. La prévalence de sites positifs pour des maladies endémiques spécifiques dans des fermes canadiennes peut généralement être comptée par centaines voir par milliers.

Ces maladies sont généralement gérées à l'échelle de la ferme, du système de production avec quelquefois des contributions régionales (provinces).

1. Mesure de biosécurité et de mitigation.
2. Immunisation (naturelle et par vaccination).
3. Traitements.

Les maladies émergentes, selon l'Office international des épizooties (OIE), sont, depuis 2006, des « infections nouvelles, causées par l'évolution ou la modification d'un agent pathogène ou d'un parasite existant. » Le caractère « nouveau » de la maladie se traduit par exemple par un changement d'hôtes, de vecteur, de pathogénicité ou de souche Wikipedia.

Les maladies émergentes sont peuvent être gérées de deux façons:

1. Contrôle voir élimination des animaux infectés (ex: fièvre aphteuse).
2. Mise en place de mesures de mitigation (ex: vaccination) pour gérer la population avec la présence de cette nouvelle maladie.