La classification suivante est proposée pour identifier les principales maladies qui sont une préoccupation par les acteurs de chacune des filières.

Les principales maladies absentes du territoire québécois et canadien et qui sont une préoccupation pour le secteur.

Maladies qui sont présentes sur le territoire québécois ou canadien et qui ont une gestion collective à l'aide d'un plan d'intervention centralisée avec des “Interventions” bien ciblées et une “Réponse” attendue (ex.: éradication).

Les maladies en émergences qui sont une préoccupation pour les différents secteurs peuvent faire partie de la liste des maladies surveillées, mais certaines maladies ou problèmes sanitaires en émergence pourraient aussi être absents de cette liste.

Maladies qui sont présentes sur le territoire québécois ou canadien et qui ont un impact économique important sans nécessairement avoir un plan d'intervention centralisé. Ces maladies peuvent être sujettes à des programmes de monitorage et de sensibilisation des producteurs (ex.: PISAQ) pour obtenir un meilleur contrôle.